Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HMX2A2RU54 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms