Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAB39Q9Y376 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms