Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms