Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HPS5Q9UPZ3 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HPS5Q9UPZ3 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms