Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1BQ9UPS6 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms