Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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