Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG3Q9UJ98 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms