Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.05■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms