Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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SH3BP4Q9P0V3 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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