Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms