Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SERINC1Q9NRX5 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SERINC1Q9NRX5 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SERINC1Q9NRX5 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SERINC1Q9NRX5 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SERINC1Q9NRX5 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SERINC1Q9NRX5 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SERINC1Q9NRX5 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SERINC1Q9NRX5 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SERINC1Q9NRX5 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SERINC1Q9NRX5 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SERINC1Q9NRX5 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SERINC1Q9NRX5 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SERINC1Q9NRX5 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SERINC1Q9NRX5 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SERINC1Q9NRX5 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SERINC1Q9NRX5 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SERINC1Q9NRX5 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SERINC1Q9NRX5 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SERINC1Q9NRX5 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SERINC1Q9NRX5 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SERINC1Q9NRX5 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SERINC1Q9NRX5 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SERINC1Q9NRX5 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SERINC1Q9NRX5 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SERINC1Q9NRX5 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SERINC1Q9NRX5 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SERINC1Q9NRX5 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SERINC1Q9NRX5 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SERINC1Q9NRX5 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SERINC1Q9NRX5 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SERINC1Q9NRX5 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SERINC1Q9NRX5 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SERINC1Q9NRX5 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SERINC1Q9NRX5 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SERINC1Q9NRX5 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SERINC1Q9NRX5 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SERINC1Q9NRX5 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SERINC1Q9NRX5 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SERINC1Q9NRX5 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SERINC1Q9NRX5 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms