Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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