Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP29Q9HBJ7 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP29Q9HBJ7 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP29Q9HBJ7 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP29Q9HBJ7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP29Q9HBJ7 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP29Q9HBJ7 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP29Q9HBJ7 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP29Q9HBJ7 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP29Q9HBJ7 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP29Q9HBJ7 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
USP29Q9HBJ7 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP29Q9HBJ7 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP29Q9HBJ7 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP29Q9HBJ7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
USP29Q9HBJ7 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
USP29Q9HBJ7 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
USP29Q9HBJ7 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP29Q9HBJ7 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP29Q9HBJ7 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
USP29Q9HBJ7 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP29Q9HBJ7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP29Q9HBJ7 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP29Q9HBJ7 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP29Q9HBJ7 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP29Q9HBJ7 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP29Q9HBJ7 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms