Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F2

TMEM38A, Trimeric intracellular cation channel type A, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM38AQ9H6F2 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM38AQ9H6F2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms