Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
VN1R3Q9BXE9 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms