Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BBS2Q9BXC9 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms