Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms