Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIN3AQ96ST3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIN3AQ96ST3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms