Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SENP8Q96LD8 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms