Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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SGCZQ96LD1 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SGCZQ96LD1 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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