Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms