Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMPDL3AQ92484 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 501.9 ms