Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEMA6DQ8NFY4 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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