Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms