Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1N4

KRT78, Keratin, type II cytoskeletal 78, humanhuman

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT78Q8N1N4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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KRT78Q8N1N4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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KRT78Q8N1N4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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KRT78Q8N1N4 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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