Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLNKQ7Z7G1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms