Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APTXQ7Z2E3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms