Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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