Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUD6

FAM69B, Protein FAM69B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM69BQ5VUD6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM69BQ5VUD6 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms