Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms