Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
C10orf55Q5SWW7 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms