Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PITRM1Q5JRX3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms