Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYTL3Q4VX76 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms