Protein–RNA interactions for Protein: Q330K2

NDUFAF6, NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF6Q330K2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF6Q330K2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms