Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSPP1Q1MSJ5 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
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