Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RBBP7Q16576 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms