Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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