Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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VPS72Q15906 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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