Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms