Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDGFRLQ15198 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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