Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms