Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SMCO1Q147U7 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms