Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHROOM2Q13796 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms