Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.563e-8■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.223e-8■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.326e-8■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 CBX3-206ENST00000481057 860 ntTSL 28.71□□□□□ -1.021e-28■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.139e-7■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 GDI2-202ENST00000380181 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.283e-40■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 GDI2-205ENST00000447751 834 ntTSL 35.52□□□□□ -1.533e-40■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.283e-9■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.973e-9■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.523e-7■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 GLE1-201ENST00000309971 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.736e-9■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 SLC2A4RG-208ENST00000496425 502 ntTSL 221.12■□□□□ 0.972e-9■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 03e-7■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.016e-34■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 EIF2D-202ENST00000367114 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.167e-8■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 GTF2H3-214ENST00000618160 3252 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.564e-7■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 EIF2D-201ENST00000271764 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.597e-8■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 EIF2D-206ENST00000472709 750 ntTSL 58.6□□□□□ -1.037e-8■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 GTF2H3-212ENST00000543341 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.084e-7■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 HSF1-208ENST00000530661 552 ntTSL 310.89□□□□□ -0.671e-6■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 CIZ1-213ENST00000471839 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 212.6□□□□□ -0.399e-9■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 OAZ1-201ENST00000581150 1131 ntTSL 520.28■□□□□ 0.842e-10■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.465e-7■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.535e-7■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 IMPDH2-209ENST00000484872 643 ntTSL 26.57□□□□□ -1.364e-7■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 HDDC2-201ENST00000318787 1350 ntTSL 1 (best)19.32■□□□□ 0.682e-10■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.372e-10■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.322e-10■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 HDDC2-209ENST00000609477 564 ntTSL 417.07■□□□□ 0.322e-10■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 HDDC2-205ENST00000608456 624 ntTSL 36.8□□□□□ -1.322e-10■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 HDDC2-208ENST00000609021 3529 nt5.3□□□□□ -1.562e-10■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 SLC9A3R2-205ENST00000564033 1087 ntTSL 222.51■■□□□ 1.192e-7■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.082e-7■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.592e-9■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 RPA3-207ENST00000483031 641 ntTSL 24.81□□□□□ -1.642e-9■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.291e-323■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 EIF3G-208ENST00000589454 873 ntTSL 513.18□□□□□ -0.38e-7■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 HAX1-203ENST00000447768 842 ntTSL 512.01□□□□□ -0.493e-8■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.218e-43■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.428e-43■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 SKP1-212ENST00000523966 899 ntTSL 35.57□□□□□ -1.528e-43■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.578e-43■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.598e-43■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.78e-43■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 SKP1-204ENST00000517691 2033 ntTSL 1 (best)3.17□□□□□ -1.98e-43■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 DPH2-209ENST00000495421 2414 ntTSL 217.7■□□□□ 0.422e-6■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.052e-6■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 DPH2-201ENST00000255108 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.062e-6■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 THOC6-210ENST00000576143 960 ntTSL 326.66■■□□□ 1.862e-7■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 THOC6-205ENST00000573704 991 ntTSL 526.66■■□□□ 1.862e-7■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.832e-7■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 THOC6-208ENST00000574957 1143 ntTSL 1 (best)25.94■■□□□ 1.742e-7■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.342e-7■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 THOC6-206ENST00000574498 788 ntTSL 322.07■■□□□ 1.122e-7■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 THOC6-204ENST00000571057 988 ntTSL 1 (best)20.66■□□□□ 0.92e-7■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 THOC6-203ENST00000571046 614 ntTSL 219.12■□□□□ 0.652e-7■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.392e-7■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.342e-7■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 UCA1-201ENST00000397381 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.84e-6■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.312e-12■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 FLOT1-202ENST00000413165 856 ntTSL 524.39■■□□□ 1.491e-6■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 EEF2-206ENST00000600720 573 ntTSL 321.98■■□□□ 1.111e-323■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.081e-6■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 SNHG6-204ENST00000521127 560 ntTSL 222.96■■□□□ 1.277e-10■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 UBXN1-205ENST00000525004 482 ntTSL 316.37■□□□□ 0.213e-9■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 TIMP1-201ENST00000218388 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.065e-74■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 TIMP1-202ENST00000377017 626 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.065e-74■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 TIMP1-204ENST00000445623 595 ntTSL 215.4■□□□□ 0.065e-74■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.163e-8■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.283e-8■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.543e-8■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 FHL3-205ENST00000485803 1468 ntTSL 1 (best)20.22■□□□□ 0.833e-8■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 ATP1B3-207ENST00000484727 657 ntTSL 26.66□□□□□ -1.345e-17■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 GAS5-222ENST00000451607 1007 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.312e-25■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 NDUFA11-203ENST00000591160 604 ntTSL 323.6■■□□□ 1.372e-16■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 GAS5-224ENST00000454068 688 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.556e-8■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 GAS5-228ENST00000456812 723 ntTSL 38.08□□□□□ -1.126e-8■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.276e-8■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 GAS5-206ENST00000422183 745 ntTSL 27.07□□□□□ -1.286e-8■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 GAS5-213ENST00000436285 772 ntTSL 24.11□□□□□ -1.756e-8■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 TAF1D-205ENST00000526015 1735 ntTSL 1 (best)19.99■□□□□ 0.794e-7■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 TAF1D-201ENST00000323981 2540 ntTSL 215.02■□□□□ -04e-7■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 TAF1D-222ENST00000546088 1728 ntTSL 37.55□□□□□ -1.24e-7■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 TAF1D-202ENST00000393259 547 ntTSL 35.76□□□□□ -1.494e-7■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 PPIH-205ENST00000440068 669 ntTSL 516.49■□□□□ 0.231e-6■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 PPIH-203ENST00000372550 665 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.721e-6■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.796e-13■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 SUMF2-206ENST00000413952 881 ntTSL 324.31■■□□□ 1.482e-6■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 AKR7A2-204ENST00000489286 725 ntTSL 523.85■■□□□ 1.416e-17■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.295e-9■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.225e-9■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 PSMB10-202ENST00000570304 851 ntTSL 222.11■■□□□ 1.133e-7■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 SUMF2-214ENST00000452216 913 ntTSL 1 (best)21.92■■□□□ 1.12e-6■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.031e-8■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.025e-9■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.016e-7■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 NCAPH2-207ENST00000520297 539 ntTSL 520.26■□□□□ 0.835e-9■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.795e-9■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 ITGB1BP1-209ENST00000464228 861 ntTSL 1 (best)19.64■□□□□ 0.735e-9■■□□□ 12.3
PABPC4Q13310 KMT5C-203ENST00000445196 2077 ntTSL 519.09■□□□□ 0.656e-7■■□□□ 12.3
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