Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLAMF1Q13291 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms