Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms