Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
STRN3Q13033 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms