Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNIP1Q12981 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms