Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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KCNMA1Q12791 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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KCNMA1Q12791 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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KCNMA1Q12791 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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KCNMA1Q12791 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
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KCNMA1Q12791 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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