Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBQ06643 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBQ06643 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBQ06643 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBQ06643 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBQ06643 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBQ06643 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBQ06643 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBQ06643 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBQ06643 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBQ06643 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBQ06643 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBQ06643 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBQ06643 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBQ06643 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBQ06643 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBQ06643 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBQ06643 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBQ06643 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBQ06643 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBQ06643 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBQ06643 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBQ06643 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBQ06643 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBQ06643 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBQ06643 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBQ06643 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBQ06643 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBQ06643 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBQ06643 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBQ06643 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBQ06643 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LTBQ06643 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBQ06643 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBQ06643 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBQ06643 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBQ06643 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBQ06643 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBQ06643 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBQ06643 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBQ06643 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBQ06643 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBQ06643 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBQ06643 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBQ06643 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBQ06643 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBQ06643 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBQ06643 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBQ06643 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBQ06643 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBQ06643 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBQ06643 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBQ06643 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBQ06643 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBQ06643 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBQ06643 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBQ06643 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBQ06643 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBQ06643 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBQ06643 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBQ06643 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBQ06643 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBQ06643 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBQ06643 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBQ06643 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBQ06643 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBQ06643 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBQ06643 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBQ06643 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBQ06643 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBQ06643 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBQ06643 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBQ06643 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBQ06643 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBQ06643 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBQ06643 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBQ06643 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBQ06643 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBQ06643 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LTBQ06643 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBQ06643 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBQ06643 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBQ06643 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBQ06643 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBQ06643 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBQ06643 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBQ06643 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBQ06643 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBQ06643 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBQ06643 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBQ06643 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBQ06643 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBQ06643 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBQ06643 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBQ06643 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBQ06643 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBQ06643 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBQ06643 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBQ06643 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBQ06643 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms